基因学苑生物云平台使用说明

2026 版 · 从登录、传文件到软件环境与 AI 工具

十一、常见问题

1 在国外可以访问服务器吗?

可以,只要有网络就可以访问。

2 如何查看自己所剩磁盘空间大小?

可以使用quota命令查看,剩余磁盘大小

quota -uvs

3 查看每个文件大小

ncdu 

4 磁盘空间不够了怎么办?

根据个人分析需求选择适合自己的服务器类型,可以选择额外增加,例如要增加1T磁盘,则每个季度增加500元,包年用户1T每年1500元。

5 为何传输数据速度很慢?

由于物理距离原因,目前从国内下载国外数据速度一般比较慢,即使用个人电脑下载速度也慢,推荐使用aspera进行下载。上传数据到服务器,国内上传速度一般可以达到3-5M/s,网速传输速度也和个人宽带条件有关,如果个人带宽较小,比如10M,那么传输速度只能达到几百K。可以通过speedtest测试网速,注意将单位设置为Mb/s。

说明配图
操作示意图(若无法加载,请参考飞书原版文档)

6 如果有需要的软件没有怎么办?

强烈推荐每个用户自行安装bioconda,通过bioconda可以很容易很方便的自己需要的软件。如果bioconda不支持,可以尝试apptainer安装。

7 是否可以开发票?

可以开发票,具体开票事宜请微信联系。

8 为何登录不上服务器?

服务器在使用过程中,偶尔会出现无法访问的问题,登录服务器需要网络,IP地址,用户名,密码这四个条件。遇到无法访问的情况,需要去排查具体的影响因素,通常是网络问题。最简单的测试方式就是使用手机网络,访问服务器网页版应用rstudio。

首先关闭无线网络,然后通过手机浏览器访问自己服务器的rstudio。例如http://v5.tongyuangene.com:11088,如果能打开则表示服务器是联通的,有可能是本地网络问题,例如端口号限制,开启VPN导致的代理异常,可以重启VPN软件。

9 共享云服务器与独享服务器有什么区别?

  1. 共享云服务器是同一台多人使用,这样更加节省成本,但没有root权限,不能为其他人开通账号。
  1. 独享云服务器可以占用全部计算资源,包含root权限,可以为其他用户开通账号;
  1. 独享云服务器适合课题组多人使用,个人适合共享云服务器;
  1. 独享云服务器价格是共享的3-4倍。

10 我该选择多大配置的设备?

因为共享服务器不能占用全部资源,因此,最好选择自己需求的2倍以上。例如拼接基因组峰值是200G内存,则建议选择512G内存以上的型号。

11 rstudio-server一直转圈圈怎么办?

rstudio网页版登录过程中,一直转圈说明上次关闭时,内存中保存了大量数据,再次登录需要较长时间加载,有时候甚至无法加载成功,这种情况需要做如下处理:

1、登录后台关闭所有rsession进程

pkill -9 rsession

2、清除缓存数据

rm -rf .local/share/rstudio/sessions/*

12 服务器登录一段时间之后为什么断了

登录服务器突然掉线可能有多种原因造成的,主要有会话超时、网络不稳定、SSH配置、客户端配置等因素。首先我们来说“自动掉线”,“自动掉线”在技术上通常称为 会话超时。服务器为了安全,默认SSH登录之后一段时间不操作就会自动掉线,具体时间由 `sshd_config`文件中的 `ClientAliveInterval`和 `ClientAliveCountMax`相乘得到,一般服务器默认是10-30分钟。这种情况容易解决,需要用户在客户端配置,例如设置每间隔一段时间向服务器发送“心动信号”。

说明配图
操作示意图(若无法加载,请参考飞书原版文档)

例如在termius中,将这个值设置为30,这样每隔30秒,软件会自动向服务器端发送一个信号,代表客户端有操作行为,不要断掉连接。

第二种情况是网络不稳定,网络在传输过程中存在不连续性,尤其是无线网络,例如其他电子设备干扰,金属物体造成的物理障碍,这种不稳定对于浏览器等软件并不明显,会有很好的连续性,电脑端不会显示网络中断,但服务器连接会突然断掉,

所以,在操作服务器时,如果运行比较长的任务,一定要使用nohup,将任务放到后台,或者使用tmux或者screen等不间断会话工具,这样即使出现掉线,也不影响任务。

13 购买完服务器资源不够是否可以升级

可以升级,只需要补差价即可。不过共享云服务器升级配置需要迁移数据,需要一些时间,因此,建议提前规划好资源使用情况,不建议频繁升级。